ログイン画面の「ブラウザにユーザID・パスワードを保存する」チェックを表示させない方法はありますか

はい、あります。

system.cfgファイルのSAVEPASSWD_COOKIE:の設定はデフォルトで「YES」になっています。それを「NO」に変更しますと、ログイン画面の「ブラウザにユーザID・パスワードを保存する」チェックは表示されないようになります。